La Certificación es el reconocimiento formal que una entidad externa (entidades certificadoras acreditadas por el INN) hace del Sistema de Gestión de la Calidad implementado por un OTEC, el que se concreta a través de la entrega de un
certificado. La certificación se lleva a cabo a través de una auditoría, realizada por auditores externos (pertenecientes a una entidad certificadora).
Esta auditoría comprende la revisión de la documentación del Sistema de Gestión de la Calidad del OTEC, así como auditorías en terreno. La certificación para los OTEC es obligatoria, por lo cual, una vez entregada la certificación, la entidad certificadora llevará a cabo auditorías de seguimiento del Sistema de Gestión de la Calidad desarrollado por el
OTEC, cada 12 meses, por el período durante el cual la certificación es válida. Si se encuentran no conformidades durante una auditoría de seguimiento y no se rectifican dentro de los tiempos especificados, se podría cancelar la certificación.